Le Centre est en première ligne pour détecter d'éventuelle épizootie. Il agit comme un relais d’information en alertant les autorités sanitaires en cas de morts suspectes. Le Centre participe également à plusieurs études visant à apporter une meilleure connaissance de l’état de santé des populations animales et ou de leurs parasites. Certaines de ces études sont menées dans le cadre de la recherche  médicale.

Le Centre accueille régulièrement des espèces victimes d’actes de  braconnage, trafic… Ces infractions, bien qu’illégales, mettent en péril de  nombreuses populations d’oiseaux. La plupart de ces individus seront incapables d’être réintroduits dans leur milieu, certains sont condamnés avant même de franchir les portes du Centre. Pour chaque atteinte portée à la faune sauvage, un dépôt de plainte ou une constitution de partie civile est engagé par le Centre.

Le Centre récolte de nombreuses informations sur les espèces qu’il recueille : localisation, causes de destruction,  présence d’une population...

Grâce aux informations collectées , le Centre produit des statistiques qui alimentent les bases de données locales et nationales, qui permettent de déterminer  les mesures et programmes de protection à mettre en place.